Lerôle de la FAA a marqué le début d'une nouvelle ère navale avec l'abandon des cuirassés au profit des porte-avions. Les pilotes de la Royal Navy s'entraînaient et étaient ensuite déployés sur les porte-avions dans le cadre de la FAA.

LaFAAparticipe à la bataille de Malte pendant la Seconde Guerre mondiale. Elle a joué un rôle important dans la défense de Malte contre les forces de l'Axe, principalement les forces aériennes italiennes et allemandes.

Au cours de labataille, la FAA a déployé divers aéronefs, notamment des chasseurs, des bombardiers et des avions de reconnaissance, afin d'assurer une couverture aérienne, de mener des raids de bombardement sur les navires et les aérodromes de l'Axe et de recueillir des renseignements sur les mouvements de l'ennemi.

Lesporte-avions HMS Eagle et HMS Ark Royal figuraient parmi les principales ressources de la FAA impliquées dans les opérations autour de Malte. Leurs avions ont contribué à protéger les convois approvisionnant l'île et à perturber les navires de l'Axe qui tentaient de renforcer l'Afrique du Nord.

Dans l'ensemble,les contributions de la Fleet Air Arm ont été essentielles à la défense de Malte et au maintien de sa position stratégique en Méditerranée pendant la guerre.

LaFAA a également joué un rôle important dans les batailles et les opérations en Extrême-Orient. Un engagement notable auquel la Fleet Air Arm a participé a été la bataille de Singapour en février 1942. Bien que la flotte principale de la Royal Navy n'ait pas été directement impliquée en raison de ses engagements ailleurs, les avions des porte-avions britanniques, dont le HMS Indomitable et le HMS Hermes, ont effectué des sorties pour défendre Singapour et ses environs. Cependant, la chute de Singapour aux mains des Japonais a marqué une défaite importante pour les forces alliées dans la région.

Après lachute de Singapour, la Fleet Air Arm a continué à opérer en Extrême-Orient, participant à des opérations telles que la défense de Ceylan (aujourd'hui Sri Lanka) et soutenant les efforts des Alliés en Birmanie et dans l'océan Indien.Tout au long de la guerre en Extrême-Orient, la Fleet Air Arm a été confrontée à des défis importants en raison des vastes distances à parcourir, des conditions tropicales difficiles et de la supériorité des forces aériennes et navales japonaises. Néanmoins, ses contributions ont été essentielles pour soutenir les opérations alliées et maintenir la pression sur les forces japonaises dans la région.